Настроить автозагрузку в операционных системах семейства Windows Server 2012 R2 и выше, можно, через реестр.
Для этого перейдите в ветку:
HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Wow6432Node\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Run
Создайте новый строковый ключ. Задайте любое имя ключа реестра и укажите путь до исполняемого файла.